Para cambiar los permisos se puede realizar a traves de la herramienta Cron Job del cPanel:
Configurar un nuevo Cron Job con la siguiente configuración:
- Una vez por minuto
- El siguiente comando, cambiando la ruta
cd /home/username/public_html && find -type f | xargs chmod 644 ; find -type d | xargs chmod 755 ; chmod 750 . -c
ó
cd /home/username/public_html && find ./ -type f -not -perm 644 -not -name ".ftpquota" -exec chmod 644 -c {} \;; find ./ -type d -not -perm 755 -not -group nobody -exec chmod 755 -c {} \;
Debe quedar así:
Eso es todo.